Su particularidad es que también allí se pueden apreciar instrumentos diversos, e históricos, de uso medicinal: un oftalmoscopio eléctrico, un hemómetro, un oscilómetro de Pachón, amigdalómetro, un dilatador de fosas nasales y trocares metálicos, entre tantos otros. Se destaca un termómetro suizo y un microscopio, ambos de fines del siglo XIX.
Los visitantes pueden así descubrir elementos de la medicina antigua y comparar la evolución tecnológica a través del tiempo. Las muestras que organiza el museo son dinámicas, creadas en función a las distintas especialidades médicas, en las cuales se expone instrumental específico de cada una de ellas.