Entre el patrimonio del museo se cuentan documentos de venta o traspaso de tierras por parte del ex gobernador Mariano Cabal, fotos antiguas, objetos arqueológicos, elementos históricos de uso doméstico, laboral y recreativo, vestimenta de épocas pasadas y herramientas agrícolas del siglo XIX y principios del XX. Este patrimonio permite al museo desarrollar actividades educativas con instituciones de la zona. El Museo Emilia Gonzales Marote se posiciona así como «un espacio de educación no formal en su compromiso de narrar la historia de su comunidad».
