Los orígenes del museo remiten a 1973, cuando ingresó a la facultad, como profesora de Anatomía Veterinaria, la doctora María del Carmen Miglietta —quien había cursado sus estudios en la Facultad de Medicina Veterinaria de Corrientes, y dominaba numerosas técnicas de conservación de piezas anatómicas—.
Esta docente —en cuyo homenaje el museo lleva su nombre— inmediatamente comenzó con la producción de esqueletos de equinos, bovinos, porcinos, caprinos y caninos, y preparados anatómicos de diferentes sistemas y órganos, aportando así las primeras colecciones que conformaron el museo. En una primera etapa, el museo funcionó en la planta baja del edificio de la entonces denominada Facultad de Agronomía y Veterinaria de Esperanza. Actualmente se halla ubicado en el Pabellón de Anatomía.
La institución integra la investigación, extensión y educación, y consta de varias colecciones agrupadas en áreas temáticas: osteología, artrología, miología, esplacnología, fauna y anatomía patológica. Es visitado por estudiantes, público en general y contingentes de otras instituciones que solicitan el desarrollo de actividades especiales teóricoprácticas.
«Planteamos al Museo de Anatomía Veterinaria como componente integrador de actividades en docencia, investigación y extensión mediante el fortalecimiento del vínculo museosociedad, manteniendo y generando actividades culturales de aprendizaje, formación, información y desarrollo bajo el concepto de comunidad social, institucional y académica», sostienen los gestores de este museo.
Actualmente, la Cátedra de Anatomía Veterinaria II y el Centro de Investigación Tecnológica llevan a cabo el diseño de un museo virtual, con piezas que han sido seleccionadas para su presentación y que incluye también fotogrametría de piezas óseas, algo que posibilita observar tridimensionalmente y en forma detallada estos preparados (https://www.fcv.unl.edu.ar/museoanatomiaveterinaria/)