El hall del museo, de un color verde claro, pretende emular el ambiente de los hangare; allí se exhibe un mural pintado por el artista cordobés Lucas Vidal: dos aviones A4C con el esquema de colores que se utilizó en la contienda del Atlántico Sur de 1982. La imagen muestra las naves operando desde una base de despliegue ubicada en Malvinas. Sobre un lateral de la obra se adosó una plaqueta de opalina con los nombres de los caídos en la guerra.
En la Sala General se relata el desarrollo de la historia de la aeronavegación y algunos momentos clave en la historia de la aeronáutica argentina. Posee un sector dedicado a la Antártida Argentina, con información sobre la Base Marambio y la primera pista iniciada por la Patrulla Soberanía.
La Sala Islas Malvinas, en tanto, se habilitó el 15 de noviembre de 2012 en el marco de los Festejos del Centenario de la Aviación Militar y a treinta años del conflicto del Atlántico Sur. La colección para esta Sala fue completada con donaciones de familiares de soldados caídos en combate, que tienen una relación directa con esta institución. El espíritu de la Sala, señalan las autoridades del museo, «es brindar un testimonio histórico de reafirmación de derechos y reconocimiento a los héroes, veteranos y veteranas que participaron en la recuperación de nuestras Islas Malvinas». La Sala tiene también un espacio dedicado a las veteranas aeronáuticas que donaron su garibaldina y placas identificatorias al museo.
En la Sala del Liceísta se muestra la vida cotidiana de los estudiantes en sus diferentes áreas de capacitación, entrenamiento y socialización. Está animada con figuras que lucen uniformes de los cadetes y alumnos de régimen externo.
El Museo del Liceo Aeronáutico Militar fue inaugurado el 22 de octubre de 2004 en ocasión de los festejos por los veinticinco años del Liceo Aeronáutico Militar. Su fondo de colección se originó a partir de objetos históricos ya existentes más sucesivas donaciones. Vale destacar la actividad que lleva adelante la Brigada Museo, un grupo de entusiastas cadetes que aprenden acerca de montajes, se interesan por la museología y son guías de las visitas guiadas.
Desde 2013, un blog inserto en la página institucional del Liceo permite al museo generar enfoques y públicos nuevos, y exponer los monumentos a cielo abierto que también forman parte del patrimonio. «Hacer difusión por este medio de las biografías de las y los pioneros en la aviación,